RFLP, RAPD, SSR
UPDATED ON:- 01-07-2023
DNA Markers:-
• परिभाषा (Definition):-
DNA का ऐसा क्षार क्रम जिसे विभिन्न आण्विक तकनीकों के उपयोग से पहचाना जा सकता है, DNA Marker कहलाता है।
(A base sequence of DNA that can be identified using various molecular techniques is called DNA Marker.)
• इन्हें Molecular Markers या Genetic Markers भी कहते हैं।
(These are also called Molecular Markers or Genetic Markers.)
• ये कई प्रकार के होते हैं। इनमें से 3 मुख्य हैं -
(They are of several types. 3 main are : -)
1. RFLP
2. RAPD
3. SSR
1. RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism):-
• परिभाषा (Definition):-
जब एक जाति के विभिन्न जीवों के DNA को एक ही Restriction Endonuclease एंजाइम से उपचारित किया जाता है तो प्राप्त DNA खण्डों की लंबाई में भिन्नता पाई जाती है।
(When the DNA of different organisms of a species is treated with the same Restriction Endonuclease enzyme, the lengths of the obtained DNA segments are differentiated.)
• RFLP के उपयोग (Applications of RFLP):-
i. जनक का निर्धारण करना
(Determination of parent)
ii. अपराधी का निर्धारण करना
(Determination of criminal)
iii. रोग की स्थिति का निर्धारण करना
(Determination of state of disease)
iv. जीन मापन (Gene mapping)
v. पादप रोगजनक का पता लगाना
(Detection of plant pathogen)
2. RAPD (Randomly Amplified Polymorphic DNA):-
• परिभाषा (Definition):-
जब दिये गए DNA का क्षार क्रम अज्ञात होता है तो छोटे संश्लेषित primers के उपयोग से इसे इसके भिन्न खण्डों की प्रतियाँ प्राप्त की जाती हैं। अब Gel Electrophoresis के उपयोग से bands प्राप्त किये जाते हैं।
(When the base sequence of a given DNA is unknown, it is amplified by using short synthetic primers to obtain copies of its different segments. Bands are now obtained using Gel Electrophoresis.)
• छोटे संश्लेषित primers में निम्न गुण होते हैं:-
(Short synthetic primers have the following properties: -)
i. लंबाई = 8 या 8 - 10 क्षार
(Length = 8 or 8 - 10 bases)
ii. यादृच्छित क्रम (Random sequences)
iii. एक समय में 1 - 10 जिनोमिक स्थलों का गुणन कर सकते हैं।
(We can amplify 1 - 10 genomic sites at a time.)
iv. ये Forward व Reverse दोनों प्रकार से कार्य कर सकते हैं।
(They can amplify in both forward and reverse directions.)
v. यदि primer संपूरक भाग से जुड़ जाता है तो गुणन कर देता है और यदि नहीं जुड़ता है तो गुणन नहीं होता है।
(If the primer attaches to the complementary part, it amplify and if not, amplification does not occur.)
vi. यदि संपूरक स्थल में उत्परिवर्तन हो जाता है तो primer इससे नहीं जुड़ पाता है। जिससे उस स्थल का गुणन नहीं हो पाता है।
(If there is a mutation in the complementary site, the primer cannot anneal to it. Due to which the amplification of that site is not possible.)
• RAPD के उपयोग (Applications of RAPD):-
i. फसली जातियों में आनुवंशिक विविधता का पता लगाना
(Detection of genetic diversity in crop species)
ii. जाति व उपजाति में Phylogenetic सम्बन्धों का अध्ययन करना
(Studying Phylogenetic Relationships among species and sub-species)
iii. किस्मों को पहचानना
(Identification of variety)
iv. जीन टैगिंग व सहलग्नता मापन
(Gene tagging and linkage mapping)
v. DNA फिंगर प्रिंटिंग
(DNA Finger Printing)
3. SSR (Simple Sequence Repeats):-
• Repetitive DNA दो प्रकार का होता है:-
(Repetitive DNA is of two types: -)
a. Microsatellite DNA
b. Minisatellite DNA
a. Microsatellite DNA:-
• इसे STR(Short Tandem Repeats) या SSR (Simple Sequence Repeats) भी कहते हैं।
[It is also called STR (Short Tandem Repeats) or SSR (Simple Sequence Repeats).]
• परिभाषा (Definition):-
DNA का वह भाग जिसमें 2 – 6 क्षार युग्म 5 – 50 बार पुनरावर्तित होते हैं, SSR कहलाते हैं।
(The part of DNA in which 2 - 6 base pairs are repeated 5 - 50 times is called SSR.)
• एक जीव के जीनोम में हजारों स्थानों पर SSR पाये जाते हैं।
(SSRs are found in thousands of locations in an organism's genome.)
• इसकी उत्परिवर्तन दर उच्च होती है। इसीलिए ये उच्च आनुवांशिक विविधता उत्पन्न करते हैं।
(It has a high mutation rate. That is why they produce high genetic diversity.)
• यह DNA का Non – Coding भाग है। इसलिए उच्च उत्परिवर्तन दर जीवों के लिए हानिकारक नहीं होती है।
(It is the Non-Coding part of DNA. Therefore high mutation rates are not harmful to organisms.)
• उदाहरण (Example):-
• यूकेरियोट्स में Genetic mapping के लिए SSR का उपयोग किया जाता है।
(SSR is used for genetic mapping in eukaryotes.)
b. Minisatellite DNA:-
• इसे VNTR (Variable Number of Tandem Repeats) भी कहते हैं।
[It is also called VNTR (Variable Number of Tandem Repeats).]
• इसमें कई 100 क्षार 1 - 4 बार repeat होते हैं।
(In this, several hundreds of bases repeats 1 - 4 times.)
